Налоговые претензии к строительным компаниям в 2026 году

Что изменилось с 1 января 2026 года

Налоговый кодекс от 18 июля 2025 года № 214-VIII ввёл отдельный вид налогового контроля: контроль выписки электронных счетов-фактур. Он проводится в двух формах, автоматизированной и сопоставительной.

Сопоставительный контроль. Налоговый орган сравнивает ЭСФ, выписанные компанией, с ЭСФ её поставщиков, налоговой отчётностью, сведениями других госорганов и данными банков второго уровня. Цель проверки определена прямо: установить, был ли оборот по реализации на самом деле. Контроль охватывает весь срок исковой давности, а не только текущий период.

Если у налогового органа возникли сомнения, поставщику направляется уведомление о подтверждении фактического совершения оборота. На ответ даётся 10 рабочих дней, тогда как раньше по камеральному контролю срок был 30 рабочих дней. Вариантов два: согласиться и отозвать ЭСФ либо представить пояснение с подтверждающими документами.

Последствия для поставщика. Если уведомление не исполнено или пояснение не принято, выписка ЭСФ приостанавливается. Приостановление урегулировано статьёй 88 Налогового кодекса, оснований для него сейчас 15. Сведения о таких компаниях публикуются на сайте уполномоченного органа. Компания, которая отозвала ЭСФ, попадает под автоматизированный контроль: чтобы выписывать новые счета-фактуры, ей придётся заранее вносить НДС на специальный баланс.

Последствия для покупателя. Покупателю этого поставщика налоговый орган направляет извещение по взаиморасчётам. С этого момента подтверждать реальность сделки предстоит уже ему. Отозванный ЭСФ считается отозванным только после подтверждения получателя, поэтому покупатель всё равно оказывается втянут в процедуру.

Масштаб. По данным КГД, только за 10 месяцев 2025 года выявлено около 3 100 налогоплательщиков с признаками выписки фиктивных ЭСФ, а подозрительный оборот составил почти 1 трлн тенге. Ведомство заявляет, что сопоставительный контроль касается небольшой категории компаний. Однако каждая такая компания может иметь десятки покупателей, и извещения получают все они.

«Чистый лист» строителей почти не защищает. Мораторий на проверки за периоды до 2026 года распространяется только на субъектов микро- и малого предпринимательства по состоянию на 1 января 2026 года. Средние и крупные подрядчики под него не подпадают.

Ужесточение продолжается. В сентябре 2026 года на публичное обсуждение вынесен проект поправок. Он добавляет новое основание для приостановления выписки ЭСФ: неисполнение уведомления о расхождениях по результатам камерального контроля. Цель контроля предлагается сформулировать прямо как пресечение ЭСФ, выписанных без фактической реализации.

Почему под удар попадают строители

Новые правила применяются ко всем отраслям. Однако у строительства есть особенности, из-за которых претензии здесь возникают чаще и обходятся дороже.

Длинные цепочки субподряда. На одном объекте работают генподрядчик, несколько субподрядчиков, поставщики материалов, арендодатели техники. Если сомнения вызвал хотя бы один участник цепочки, извещения расходятся по всем, кто с ним рассчитывался. Генподрядчик, который сам работы выполнил и сдал заказчику, может узнать о проблеме только из извещения.

Работы трудно проверить задним числом. Поставленный товар можно найти на складе. Выполненные работы скрыты под отделкой или в фундаменте, а объект давно сдан. Если исполнительная документация велась формально, доказывать реальность работ через год-два очень сложно.

«Нет ресурсов» как довод налогового органа. Субподрядчики часто арендуют технику и привлекают людей под конкретный объект. Для системы управления рисками компания без собственных основных средств и с небольшим штатом выглядит подозрительно. Тот же довод налоговые органы приводят в проверках: у поставщика не было материальных и трудовых ресурсов для выполнения работ.

Рост объёмов. За январь–июнь 2026 года объём строительных работ вырос на 15,2% и превысил 4 трлн тенге. Больше работ означает больше счетов-фактур, а значит, больше совпадений с критериями риска.

Налоговая реформа меняет структуру рынка. Ставка НДС выросла до 16%. Работать с небольшими подрядчиками на упрощённом режиме генподрядчикам стало менее выгодно. Участники рынка в Шымкенте оценивают сокращение числа предпринимателей в строительстве примерно в 11% за год. Когда подрядчики массово уходят с рынка или меняют форму работы, в цепочках появляется больше компаний, которые уже не отвечают на уведомления.

Как обычно развивается ситуация

В делах, с которыми к нам приходят, события почти всегда идут в одной последовательности.

1. Субподрядчик или поставщик получает уведомление о подтверждении фактического совершения оборота.
2. Он не отвечает, отвечает формально или налоговый орган не принимает его пояснение. Нередко к этому моменту субподрядчик уже не выходит на связь.
3. Субподрядчику приостанавливают выписку ЭСФ, сведения об этом появляются на сайте налогового органа.
4. Генподрядчик получает извещение по взаиморасчётам с этим субподрядчиком. Теперь подтверждать реальность работ должен он сам.
5. Если подтвердить не удалось, налоговый орган ставит вопрос о зачёте НДС и вычетах по КПН. Дальше возможны уведомление о расхождениях и налоговая проверка с доначислением налога, пени и штрафа.

Самая частая ошибка совершается на втором и четвёртом шаге: компания отзывает или соглашается отозвать ЭСФ, чтобы быстрее закрыть вопрос. Для поставщика это фактически признание того, что оборота не было, и автоматизированный контроль на будущее. Для покупателя это потеря зачёта по НДС и расходов по КПН. Отменить такое решение потом гораздо труднее, чем не принимать его сразу.

Что делать, если пришло уведомление или извещение

Проверьте срок в день получения. На уведомление о подтверждении оборота отводится 10 рабочих дней. При неисполнении меры применяются уже на следующий рабочий день. Пропущенный срок лишает компанию самой дешёвой стадии защиты.

Не отзывайте ЭСФ без анализа. Сначала нужно понять, по каким счетам-фактурам и за какой период у налогового органа сомнения. Затем оценить, какими документами вы можете подтвердить работы. Решение об отзыве допустимо только в одном случае: оборота действительно не было.

Отвечайте по существу. Пояснение пишется в произвольной форме, но формальный ответ из двух абзацев почти никогда не срабатывает. В нём должно быть видно, какие работы выполнены, на каком объекте, в какие сроки, кем и с какой техникой. Каждое утверждение подкрепляется документом. Перечень документов приведён ниже.

Если вы покупатель, действуйте сразу по двум направлениям. Во-первых, свяжитесь с поставщиком и запросите у него документы, пока он доступен. Во-вторых, соберите собственные доказательства: ваши журналы, акты, переписку, данные технадзора. Документы самого генподрядчика нередко оказываются убедительнее, чем документы исчезнувшего субподрядчика.

Используйте право быть выслушанным. Административный процедурно-процессуальный кодекс обязывает госорган дать участнику процедуры возможность изложить позицию до принятия неблагоприятного решения. По словам судей специализированного административного суда Алматы, вероятность отмены акта заметно растёт, если госорган не выслушал заявителя, не исследовал его доказательства или применил чрезмерную меру. Поэтому все контакты с налоговым органом стоит фиксировать письменно.

Если пояснение не приняли, решение налогового органа можно обжаловать в досудебном порядке, а затем в административном суде. На этом этапе к делу лучше привлечь юриста, который будет вести его до конца.

Обжалование доначислений

Если дело дошло до налоговой проверки, у компании есть три уровня защиты. Пропускать первые два нельзя: без них суд, как правило, не рассмотрит спор по существу.

Возражение на предварительный акт. С 2026 года предварительный акт налоговой проверки вручается всем налогоплательщикам, а не только при крупных доначислениях. На письменное возражение отводится 15 рабочих дней. Это первая возможность представить документы до того, как выводы проверки будут оформлены окончательно.

Жалоба в Апелляционную комиссию Министерства финансов. Жалоба на уведомление о результатах проверки подаётся в течение 30 рабочих дней с его получения. На время рассмотрения исполнение уведомления в обжалуемой части приостанавливается. Для компании с крупным доначислением это защищает от блокировки счетов, пока спор не решён.

Комиссия отменяет результаты проверок регулярно. За девять месяцев 2026 года в неё поступило 323 жалобы, рассмотрено 194. Результаты 57 проверок отменены полностью или частично. На совещании Департамента апелляций Минфина и КГД отдельно разбиралось качество проверок взаиморасчётов с неблагонадёжными поставщиками. Среди причин отмены названы недостатки анализа цепочек прослеживаемости и оценки того, мог ли поставщик выполнить работы или оказать услуги. Для строительных споров это прямой аргумент: сомнения в реальности работ налоговый орган должен обосновать, а не просто констатировать.

Административный суд. Срок обращения в суд после решения по жалобе ограничен, его нужно отслеживать с даты вручения решения. По Административному процедурно-процессуальному кодексу законность своего решения доказывает госорган, а не предприниматель. Специализированный административный суд Алматы за первые пять месяцев 2026 года удовлетворил 51% рассмотренных исков. Налоговые споры входят в число самых частых категорий.

Какие документы стоит собрать заранее

В строительных спорах решает не количество документов, а то, складываются ли они в связную картину: кто, где, когда и чем выполнял работы. Мы рекомендуем вести и хранить по каждому субподрядчику следующий комплект.

Договор и расчёты

• договор подряда или субподряда с приложениями, сметой и графиком работ;
• акты выполненных работ (ЭАВР) и справки о стоимости, привязанные к этапам и объекту;
• платёжные поручения и акты сверки взаиморасчётов.

Подтверждение самих работ

• общий журнал работ с записями субподрядчика;
• акты освидетельствования скрытых работ, исполнительные схемы;
• документы технического и авторского надзора с упоминанием субподрядчика;
• фотографии и видео с объекта с датами.

Ресурсы субподрядчика

• списки персонала, пропуска на объект, документы по охране труда;
• договоры аренды техники, путевые листы, документы на доставку;
• СНТ, накладные и ЭСФ на материалы, использованные при выполнении работ.

Проверка контрагента при заключении договора

• регистрационные данные, статус плательщика НДС, отсутствие приостановления выписки ЭСФ;
• документы, подтверждающие право контрагента выполнять такие работы;
• переписка по договору: письма, протоколы совещаний, согласования.

Чем раньше этот комплект собран, тем меньше риск, что через год ключевые документы будет взять неоткуда.

Наша позиция

Новый механизм создавался против компаний-однодневок и обналичивания, и сама эта цель понятна. Но устроен он так, что последствия выходят далеко за пределы однодневок. Под проверку попадают подрядчики, которые реально строили, но вовремя не ответили на уведомление или не сохранили исполнительную документацию.

Опыт показывает, что такие споры выигрываются. Налоговый орган должен обосновать свои сомнения, а суды и Апелляционная комиссия проверяют, насколько глубоко он разобрался в цепочке. Решающим обычно оказывается то, сколько времени у компании было на подготовку позиции и какие документы у неё на руках.

Если ваша компания получила уведомление, извещение или акт налоговой проверки, обратитесь к нам до истечения срока на ответ. Юристы ERNST & PARTNERS LAW FIRM сопровождают налоговые споры на всех стадиях: от пояснения по уведомлению до административного суда, апелляции и кассации.

Наш офис находится в Астане, ул. Достык, 5. Связаться с нами можно через форму на сайте ernst-partners.kz.